顺治十八年（）年五月，经议政王大臣会议的讨论，四辅臣的点头认可，以幼帝玄烨的名义下了一道重要的旨意：江南析为江苏、安徽二省，即历史上的“江南分省”。
此二省的命名方式比较简单，“江苏”取江宁、苏州二府首字；“安徽”取安庆、徽州二府首字。不过当时还有另外一种说法，以长江流经地位位置为准，称江苏为“下江”，称安徽为“上江”。
其实，江南省这个名字在历史上存在的时间很短，顺治二年豫亲王多铎攻占南京后，朝廷对于南京的体制问题展开了激烈的争论。
不少人认为应当沿袭明制，仍以南京为“陪都”，保留南直隶的现有体制。但摄政王多尔衮等满洲贵族认为南直隶作为南方的政治、经济中心影响力极大，对新朝的统治存在威胁，最终决定降低其行政等级，降为行省。
是年七月，朝廷颁布谕旨，将南直隶改为江南省，应天府改为江宁府，取消应天府尹的建制，以知府为最高长官。
从顺治二年建江南省，到顺治十八年江南分省，只有短短的17年时间。那么江南为何要分省呢？主要有以下几个原因：
其一、地域太广江南不“江南”
江南省的行政区划大致与明南直隶相同，如果以现在的情况来看，江西婺源，湖北英山以及浙江的部分区域，都隶属南直隶。
南直隶的北至徐州、南至松江，两府之间的距离超过里。在黄河未改道之前，南直隶横跨黄河、淮河、长江三大流域。
如果按照长江来划分的话，南直隶有一多半属于“江北地区”；若是秦岭、淮河为界的话，那么徐州、宿州等地，则要划入“河北地区”。
历史上江南被定义为“长江以南地区”，实际上真正的江南主要还是指长江下游以南地区，更具体地说应是苏南、皖南、浙北这一区域。
江南省由于跨度太大，境内的经济、文化，以及气候等千差万别。如果仍以“江南省”为名，那么就有点差强人意了。故而分省势在必行。
其二、统治基础不稳固
清初时期，江南省一直是朝廷最头疼的地方，反清起义一波未平一波又起。究其根源，主要是江南这个地方受明代统治思维的影响，遗老遗少皆以朱明王朝为正统。
明太祖起于淮右，老家就在凤阳。大明建国后又定都南京，老朱家的根就在南直隶，清统治者要想彻底消灭“前明余孽”，绝非是短时间内能办到的，或者说根本办不到。
事实也证明，江南一带一直到康熙年间，反清意识仍然根深蒂固。后来康熙帝、乾隆帝六次南巡，其最终目的就是为了笼络江南人心，并几次至明孝陵祭拜朱元璋。
既然无法消除江南子的反清思想，那么分省就显得很有必要。作为朱明王朝的两个重要的“据点”，凤阳被分给了安徽，南京被分给了江苏，并以不同的行政区进行管理，如此便能在一定程度上遏制反清情绪的蔓延。至少，不是一个省的人，少了“同乡”这条纽带，多少总会生疏一些。
其三、政务太繁顾头难顾腚
江南省是全国最富庶的地区，文献记载：“江南田赋之供，当天下十之三；漕糈，当天下十之五；又益江淮之盐策，关河之征榷，是以一省当九州之半未已也”。
清初时期，国家岁入接近一半来自江南，乾隆朝国力鼎盛时期，两江财赋也占了将近三分之一。
明代时南直隶由于是“陪都”，其钱粮征收主要是南京户部统筹，其下各巡抚皆听节制。这套制度通过实践被证明是行之有效的。
顺治朝废南直隶后，以江南总督为最高长官，但当时还是以军事斗争为主，江南总督无暇顾及民政。
实际负责民政事务的是两个巡抚，一为“江南巡抚”（驻苏州），辖区江宁、苏州、镇江、松江、常州等江南诸府；二为“凤庐巡抚”（驻淮安），辖江北诸府。
布政使、按察使也设两员，以地域进行划分，分管钱粮、刑名事务。不难看出，顺治朝时江南省的政务实际上按照江南、江北的地理区域进行管理的。
可即便如此，江南省的政务仍是难以顺利开展，尤其是长江为界限划分职责，容易出现一些扯皮、推诿的情况，在总督分身乏术的情况下，两个巡抚谁也不服谁。这也是后来分省时没有以长江为界，而是以东西两向划分的原因之一。
其四、分省有利于平衡科举取士
江南省成立后的第二年，即顺治三年清王朝第一次开科取士。江南省乡试发榜以后，位居榜单的大多数出自江南各府，尤以苏州、江宁、常州、镇江、徽州等府人数最多。
而江北地区自古文风较低，虽然参加乡试的考生比江南还要多，但取中的不及江南的三分之一。
乡试是有名额的，每个省的举人数量都有定数，当时江南为6名。然而这些名额绝大部分被江南等府垄断，使得江北的读书人无缘功名，这就引起来很大的矛盾。
会试同样也是如此，不过顺治朝时实行的是南、北、中卷取士的制度。江南省考生被划在了南卷，而实际录取的进士，也是绝多数出自江南各府。
科举取士一旦出现录取比例不平衡，将会严重威胁到统治基础。故而江南分省以后，采取了分省取士的办法，安徽、江苏各自都有自己的名额。
如此一来虽然江苏省的竞争更加激烈的，但却在一定程度上缓和了取士不公所带来的政治问题。
江南分省后的最初几年，安徽省的地位一直比较尴尬。这是因为安徽的主要领导干部巡抚、布政使、按察使都在江宁。
大约在康熙六年，安徽巡抚才正式入驻安庆（也有说是康熙元年），乾隆二十五年，安徽布政使才移驻安庆。也就是说，安徽建省的近一百年间，省会一直在江宁。
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