我国很多知名大学的起源于清末，其主要发展时期却是在民国。
与世界知名大学的教会根源一样，从年到抗战全面爆发前，国内大学直接引进西方近代教育模式，有13所教会创办大学，堪称世界级大学。这些大学，在教育近代化过程中起着重要示范与导向作用，培养了大批知识界的精英，在社会上产生深远影响。
遗憾的是，因年院校大调整，这些教会大学被重组兼并，其名字也逐渐被历史忘记。
曾为世界名校的燕京大学
燕京大学创办于年，由华北地区教会大学合并而成，包括北京汇文大学、华北协和大学等，分别由美国长老会、女公会、英国伦敦会等合办，初期名为“北京大学”。
司徒雷登年任校长后，更名为燕京大学。随后开始建设新校区，向社会各界募捐。从年起，正式设立了文学院、理学院、法学院，总共有近20个系。曾与哈佛大学合作成立哈佛—燕京学社，该大学成为当时中国规模最大、质量最好、环境最优美的大学。
燕大诞生于五四时期，作为那个时代高等教育的重要代表，其教授与毕业生包括埃德加.斯诺、雷洁琼、吴文藻、冯友兰、钱穆、周作人、郑振铎、冰心等一大批重量级人物。
年院系调整中，燕京大学被撤消。文科、理科多并入北京大学，工科并入清华大学，法学院、社会学系并入中国政法大学。校舍由北京大学接收，其实还有一部分人员早期并入香港中文大学崇基学院。
北平四大名校的辅仁大学
年，辅仁大学由罗马教廷创办。其曾与北大、清华、燕京并称北平四大名校，拥有浓厚的天主教色彩。胡适、翁文灏、季羡林、郑振铎等名师都曾在辅仁任教。
年高校调整过程中被撤销，其校舍划入北京师范大学的北校区，人员与系所分别并入北京大学、北京师范大学、中国人民大学、中国政法大学、中央财经大学等。
年，在台湾地区复校，全名“天主教辅仁大学”，简称辅大，大家比较熟知的赖声川、胡茵梦、吴佩慈、吴小莉、蔡依林、吴奇隆等，都毕业于辅仁大学。
齐鲁大学与山东大学没有关联
齐鲁大学正式校名为山东基督教共和大学，为年至年在山东省一所教会大学，由来自美国、英国以及加拿大的14个基督教教会组织联合开办。鼎盛时号称“华北第一学府”，与燕京大学齐名，有“南齐北燕”之称。大陆许多知名学者如老舍先生、历史学家顾颉刚、墨学大师栾调甫、戏剧学家马彦祥等纷纷到此执教。
作为当年外国人创办的十三所教会大学之一，在年院校大调整中，齐鲁大学各学科分别被并入山东大学、山东师范大学、山东农业大学、中国药科大学、南京大学等高校。
虽然齐鲁大学和山东大学同处山东，但是这两所大学几乎没有关联。齐鲁大学是一所历史悠久的教会大学，与山东大学是两所不同性质、不同风格、相互独立的大学。这两所著名高校，因为医学院的兼并，在年才走到了一起。
东吴大学的法学很强大
东吴大学是我国第一所民办大学。于年由基督教监理会在中国苏州创办，其法学教育在当时饮誉海内外，是中国第一所西制大学。
年中国院系调整时，东吴大学与苏南文化教育学院、江南大学数理系合并为苏南师范学院，同年定名为江苏师范学院，在原东吴大学校址办学，年经国务院批准改办为苏州大学。
东吴大学在上海的法学院，并入华东政法学院，也就是今华东政法大学，会计系并入上海财政经济学院，今上海财经大学。年，台湾地区也复校东吴大学，金庸先生就毕业于东吴大学。
首个全英语授课的圣约翰大学
上海圣约翰大学，前身是创建于年的圣约翰书院，年升格为圣约翰大学，是在华办学时间最长的一所教会学校。
年，圣约翰大学开始招收研究生，年开始招收女生，后来发展成为一所拥有5个学院16个系的教会大学，是当时上海乃至全国最优秀的大学之一。圣约翰大学是我国首个全英语授课的大学，以“光与真理”为校训。有“东方哈佛”和“外交人才养成所”之雅称，该校培育了林语堂、张爱玲、邹韬奋、顾维钧、宋子文、荣毅仁、刘鸿生、贝聿铭、施肇基等一大批影响中国历史的杰出人物。
年，圣约翰大学原校址给华东政法大学，一代名校就此消弭于历史长河。
震旦大学
震旦大学是法国天主教耶稣会在上海创办的著名教会大学，由中国神父马相伯于年2月，在徐家汇天文台旧址创办。所设学科有语文、象数、格物、致知四门。
震旦是印度对中国旧称，建校初始，学校以“广延通儒，培养译才”为宗旨，倡导学术民主、思想自由，先后培养了戴望舒、何振梁、徐悲鸿、翁文灏等一批知名人物。
年院系调整，震旦大学各院系分别归并复旦大学、上海交通大学、同济大学等。
之江大学
之江大学是基督教美北长老会和美南长老会在中国杭州联合创办的一所教会大学，林汉达、金仲华、朱生豪等知名人士都是之大校友。
年院系调整拆分至浙江师范学院、浙江大学、复旦大学等，之江大学宣告结束。
“江东之雄”的金陵大学
金陵大学是美国基督教会美以美会在南京创办的教会大学。教育家陶行知、诺贝尔文学奖获得者赛珍珠、哲学家方东美、文学史家程千帆等著名校友均出自于此。
金陵大学是第一个向中国政府请求立案并获批准的教会大学。在美国加利福尼亚大学大学编类中，金陵大学是教会大学中唯一的A类，持有金陵大学学位的毕业生，有资格直接进入美国大学的研究生院，享有“江东之雄”、“钟山之英”之美誉。
年高校院系调整，金陵大学撤销建制，主体并入南京大学，其余院系参与组建南京农学院、南京师范学院等高校，其历史档案划归南京大学。
岭南大学
岭南大学前身为格致书院，开创了华侨教育的先河，由美国基督教长老会于年在广州创办。年4月学校宣布停办。年岭南大学在院系调整中与中山大学及其他院校的文、理科合并，组成现在的华南理工大学，中山大学。
洗星海、廖承志、梁羽生、陈香梅等著名人物均毕业于岭南大学。
“东亚第一”的华西协和大学
华西协和大学是成都乃至西部第一所现代化意义的大学。抗战时期，这里成为保存、延续中国高等教育命脉的圣地之一。
这里是我国牙科学的发源地，享有了“东亚第一”的美誉，其文理哲各科在当时的西南地区也是处于顶端的位置。其所实施的教育以西学、神学为重，其教员大多来自英、美、加三国。
在西方著名教育家波尔顿、张伯伦的指导下，学校组织管理按“协合”的原则，仿照牛津、剑桥大学的体制，实行“学舍制”，即每个差会建立和资助自己的学院，管理自己的资金和设备。华西协合大学的组织方案、专业设置、课程计划、教育管理等都采用了当时英美较为先进的水平。
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